丹东市疾病预防控制中心高通量基因测序平台采购招标公告
日期:2024-02-02
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一、项目基本情况
项目编号:Jp4-210600-00312
项目名称:丹东市疾病预防控制中心高通量基因测序平台采购
包组编号:001
预算金额(元):2,550,000.00
最高限价(元):2,550,000
采购需求:查看
技术需求
(一)用途
主要用于全基因组测序、转录组测序、微生物宏基因组测序,靶向测序、遗传病测序、肿瘤测序等。
(二)技术参数
1.可通过电脑端操作也可直接通过触控屏操作设备。
2.测序仪可进行一级分析,输出FASTQ原始文件及测序质量分析等测序信息。
3.测序仪可满足未知感染宏基因组测序、分型及溯源等应用。
4.支持自动单端测序和双端测序,配合光学检测技术。
5.测序试剂预置,一键加液,测序清洗试剂一体化,自带清洗维护程序,测序结束后自动清洗设备。
★6.测序仪采用双模设计,可根据实验需要选择单独、同时、滚动上样,单模块可提供≥80M的reads数,双模块合计可提供≥160M的reads数。
7.测序仪主机单次开机检测最高数据通量≥80Gb。
8.测序仪主机操作系统及说明书语言:标配中文,测序仪主机操作系统中文和英文可选。
★9.测序仪基于线性扩增技术,每次扩增都以原始DNA单链环为模板,有效避免PCR扩增错误指数积累。
10.低标签跳跃:通过各项技术可有效降低标签跳跃,保证数据准确性。
★11.读长支持:支持读长类型至少应包括SE100、PE150、PE250、PE300,或更多类型。
12.测序时长:读长SE100时测序
≤5小时,整机最高产出数据量≥16G;读长PE150时测序
≤12小时,整机最高产出数据量≥48G。
13.数据质量:读长为PE50,数据质量Q30>90%;读长为PE150,数据质量Q30>85%;读长≥PE250,数据质量Q30>75%。
14.建库试剂方案完整,可提供与测序仪生产厂家同品牌的DNA、RNA文库制备试剂套装(建库试剂盒)同时支持开放试剂及耗材,并能提供现场技术支持(供应商须在投标文件中提供相应承诺函)。
★15.配备自动化样本制备系统,内置扩增仪,配备≥96通道移液器,单次运行支持≥96个样本文库制备,内置紫外消毒系统及空气洁净系统,可自动化实现扩增及纯化等建库流程。
16.自动化样本制备系统,支持移液体积范围 2 ul-200 ul范围, 移液分辨率≤0.1ul。加样精度:CV≤5%(2μl时),准确度:<±10%; CV≤1%(200μl时),准确度:<±1%。
★17.配备外置本地化服务器,至少满足内存192GB DDR4,固态硬盘2TB+250GB,机械硬盘30TB。服务器内置中文微生物快速识别软件、微生物组装溯源软件、新冠病毒分析软件,软件更新时可提供本地更新。
18.微生物快速识别软件可进行宏转录组数据分析、宏基因组数据分析,以及DNA/RNA 数据共分析,对原始样本中的微生物核酸序列进行分析和鉴定,并自动生成鉴定结果和分析报告。
19.微生物快速识别软件内置物种数据库,包括10种以上的宿主物种,人、猪、山羊、绵羊、小鼠等;同时,支持定制化开发更多宿主物种。
20.微生物快速识别软件收录不低于2万种微生物,涵盖细菌、真菌、病毒、寄生虫及古生菌等。
21.微生物组装溯源软件,包含多个分析模块可对细菌、真菌、病毒等病原微生物的测序数据,实现从测序下机数据到基因组组装、系统进化分析,并自动计算变异检测结果供研究参考。
22.新冠病毒分析软件,可进行多重PCR打断技术测序数据的分析。包含数据质控、组装、变异注释、分型、溯源功能,测序完成后可自动传输数据并分析。
★23.配备中文遗传病测序、肿瘤测序分析软件,分析软件可进行遗传变异检测与分析,实现碱基质量分数校正、体细胞突变检测功能。
24.遗传病测序、肿瘤测序分析软件具备质控功能,用于去除低质量序列、接头及杂质,可产生包含碱基质量分布、GC含量、接头污染等详尽指标的报告。具备序列比对功能,可将二代测序产生的reads高效映射到参考基因组上。
25. 遗传病测序、肿瘤测序分析软件具备注释变异的功能效应,结合数据库信息解析变异数据,提供变异功能性影响、基因定位及已知突变匹配的内容。
26.配备荧光计,用于测序质控,至少满足测量范围300-1000 nm,处理
:≤5 秒/样品。
27.配备磁力架,用于磁珠纯化等过程,至少满足16个标准孔位。
28.配备振荡器及微型离心机,用于测序样品前处理。振荡器至少满足振动与旋涡混合方式,转速≥2800转/分,微型离心机至少满足1.5/2mL离心管的沉淀或离心,转速≥10000转/分。
(三)配置
1.基因测序仪 1台
2.自动化样本制备系统 1台
3.本地化服务器 1台
4.微生物快速识别软件 1套
5.微生物组装溯源软件 1套
6.新冠病毒分析软件 1套
7.遗传病测序和肿瘤测序分析软件 1套
8.荧光计 1台
9.测试荧光计所需试剂 1套
10.磁力架 1套
11.振荡器 1台
12.微型离心机 1台
★13.配备必要测试及培训试剂(96人份/套)
13.1开机测试试剂1套
13.2测序技术全流程培训所需新冠检测试剂3套,细菌全基因组检测试剂1套
合同履行期限:自合同签订之日起15天内供货并验收合格(具体以签订合同内容为准)
需落实的政府采购政策内容:按照落实政策为促进中小企业、促进残疾人就业、支持监狱企业、支持脱贫攻坚、对于节能产品、环境标志产品、对于列入《辽宁省创新产品和服务目录》内的产品、服务等相关政策标准执行。
本项目(是/否)接受联合体投标:否
二、供应商的资格要求
1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定。
2.落实政府采购政策需满足的资格要求:无
3.本项目的特定资格要求:无
三、获取招标文件
:20
02月0
15时30分至20
02月0
16时30分(北京
,法定节假日除外)
项目编号:Jp4-210600-00312
项目名称:丹东市疾病预防控制中心高通量基因测序平台采购
包组编号:001
预算金额(元):2,550,000.00
最高限价(元):2,550,000
采购需求:查看
技术需求
(一)用途
主要用于全基因组测序、转录组测序、微生物宏基因组测序,靶向测序、遗传病测序、肿瘤测序等。
(二)技术参数
1.可通过电脑端操作也可直接通过触控屏操作设备。
2.测序仪可进行一级分析,输出FASTQ原始文件及测序质量分析等测序信息。
3.测序仪可满足未知感染宏基因组测序、分型及溯源等应用。
4.支持自动单端测序和双端测序,配合光学检测技术。
5.测序试剂预置,一键加液,测序清洗试剂一体化,自带清洗维护程序,测序结束后自动清洗设备。
★6.测序仪采用双模设计,可根据实验需要选择单独、同时、滚动上样,单模块可提供≥80M的reads数,双模块合计可提供≥160M的reads数。
7.测序仪主机单次开机检测最高数据通量≥80Gb。
8.测序仪主机操作系统及说明书语言:标配中文,测序仪主机操作系统中文和英文可选。
★9.测序仪基于线性扩增技术,每次扩增都以原始DNA单链环为模板,有效避免PCR扩增错误指数积累。
10.低标签跳跃:通过各项技术可有效降低标签跳跃,保证数据准确性。
★11.读长支持:支持读长类型至少应包括SE100、PE150、PE250、PE300,或更多类型。
12.测序时长:读长SE100时测序
13.数据质量:读长为PE50,数据质量Q30>90%;读长为PE150,数据质量Q30>85%;读长≥PE250,数据质量Q30>75%。
14.建库试剂方案完整,可提供与测序仪生产厂家同品牌的DNA、RNA文库制备试剂套装(建库试剂盒)同时支持开放试剂及耗材,并能提供现场技术支持(供应商须在投标文件中提供相应承诺函)。
★15.配备自动化样本制备系统,内置扩增仪,配备≥96通道移液器,单次运行支持≥96个样本文库制备,内置紫外消毒系统及空气洁净系统,可自动化实现扩增及纯化等建库流程。
16.自动化样本制备系统,支持移液体积范围 2 ul-200 ul范围, 移液分辨率≤0.1ul。加样精度:CV≤5%(2μl时),准确度:<±10%; CV≤1%(200μl时),准确度:<±1%。
★17.配备外置本地化服务器,至少满足内存192GB DDR4,固态硬盘2TB+250GB,机械硬盘30TB。服务器内置中文微生物快速识别软件、微生物组装溯源软件、新冠病毒分析软件,软件更新时可提供本地更新。
18.微生物快速识别软件可进行宏转录组数据分析、宏基因组数据分析,以及DNA/RNA 数据共分析,对原始样本中的微生物核酸序列进行分析和鉴定,并自动生成鉴定结果和分析报告。
19.微生物快速识别软件内置物种数据库,包括10种以上的宿主物种,人、猪、山羊、绵羊、小鼠等;同时,支持定制化开发更多宿主物种。
20.微生物快速识别软件收录不低于2万种微生物,涵盖细菌、真菌、病毒、寄生虫及古生菌等。
21.微生物组装溯源软件,包含多个分析模块可对细菌、真菌、病毒等病原微生物的测序数据,实现从测序下机数据到基因组组装、系统进化分析,并自动计算变异检测结果供研究参考。
22.新冠病毒分析软件,可进行多重PCR打断技术测序数据的分析。包含数据质控、组装、变异注释、分型、溯源功能,测序完成后可自动传输数据并分析。
★23.配备中文遗传病测序、肿瘤测序分析软件,分析软件可进行遗传变异检测与分析,实现碱基质量分数校正、体细胞突变检测功能。
24.遗传病测序、肿瘤测序分析软件具备质控功能,用于去除低质量序列、接头及杂质,可产生包含碱基质量分布、GC含量、接头污染等详尽指标的报告。具备序列比对功能,可将二代测序产生的reads高效映射到参考基因组上。
25. 遗传病测序、肿瘤测序分析软件具备注释变异的功能效应,结合数据库信息解析变异数据,提供变异功能性影响、基因定位及已知突变匹配的内容。
26.配备荧光计,用于测序质控,至少满足测量范围300-1000 nm,处理
27.配备磁力架,用于磁珠纯化等过程,至少满足16个标准孔位。
28.配备振荡器及微型离心机,用于测序样品前处理。振荡器至少满足振动与旋涡混合方式,转速≥2800转/分,微型离心机至少满足1.5/2mL离心管的沉淀或离心,转速≥10000转/分。
(三)配置
1.基因测序仪 1台
2.自动化样本制备系统 1台
3.本地化服务器 1台
4.微生物快速识别软件 1套
5.微生物组装溯源软件 1套
6.新冠病毒分析软件 1套
7.遗传病测序和肿瘤测序分析软件 1套
8.荧光计 1台
9.测试荧光计所需试剂 1套
10.磁力架 1套
11.振荡器 1台
12.微型离心机 1台
★13.配备必要测试及培训试剂(96人份/套)
13.1开机测试试剂1套
13.2测序技术全流程培训所需新冠检测试剂3套,细菌全基因组检测试剂1套
合同履行期限:自合同签订之日起15天内供货并验收合格(具体以签订合同内容为准)
需落实的政府采购政策内容:按照落实政策为促进中小企业、促进残疾人就业、支持监狱企业、支持脱贫攻坚、对于节能产品、环境标志产品、对于列入《辽宁省创新产品和服务目录》内的产品、服务等相关政策标准执行。
本项目(是/否)接受联合体投标:否
二、供应商的资格要求
1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定。
2.落实政府采购政策需满足的资格要求:无
3.本项目的特定资格要求:无
三、获取招标文件
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联系人:刘欣
电话:010-68809590
手机:13522553206(欢迎拨打手机/微信同号)
邮箱:kefu@bidnews.cn
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