一、项目基本情况 项目编号：YNZC2025-G3-********-YNZG-0050 项目名称：云南省农业科学院粮食作物研究所大豆课题宏转录组、WGS-GWAS、RNA-seq分析服务项目采购(********） 预算金额（万元）：******** 最高限价（万元）：******** 采购需求：1、WGS-GWAS，服务要求：实验：total DNA>1μg；释测序平台：illumina；测序策略：PE150；Q20≥90%；Q30≥85%；测序深度：5×以上；分析内容：测序数据质控（原始序列数据、测序数据统计、测序数据质量评估）；与参考基因组比对；SNP检测与注释；INDEL提取，群体分层分析（群体进化树分析、群体主成分分析）；连锁不平衡分析；全基因组关联分析（性状关联分析、目标性状相关区域基因功能注释）；构建单倍型图谱等。2、宏转录组，服务要求：使用Illumina NovaSeq X Plus仪器进行PE150双端测序，每个检测样本的数据量不低于6G clean data，Q30>90%；具有数据分析团队和服务器集群分析平台，提供专属高级宏转录组云分析流程，在线自主设置参数动态交互分析，绘图可直接下载。生物信息学分析：交互分析（不包括云工具）完成标准分析60+项：（1）数据预处理；（2）序列拼接组装：（3）基因预测：对拼接结果中的contigs进行ORF预测。（4）非冗余基因集构建（5）基因丰度统计（6）注释分析：使用DIAMOND将非冗余基因集与注释数据库进行比对（7）组成分析：基于物种丰度表和功能丰度表，进行物种与功能组成分析，提供Venn图、Bar图和Pie图、Heatmap图等。（8）比较分析：基于物种丰度表和功能丰度表，进行物种/功能比较分析，PCA分析、PCoA分析等。（9）差异分析：基于物种丰度表和功能丰度表，进行物种/功能差异分析（10）相关性分析（11）群落生物标志物筛选：随机森林，联合ROC分析，物种与功能贡献度分析、WGCNA分析等。3、RNA-seq，服务要求：使用IlluminaNovaSeqXPlus仪器进行PE150双端测序，每个检测样本的数据量不低于6Gcleandata，Q30>90%；具有数据分析团队和服务器集群分析平台，提供专属高级真核有参转录组云分析。; 合同履行期限：标段1:完成期限为接到送检样品之日起3历天内完成。 本项目（否）接受联合体投标。 二、申请人的资格要求： 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定； 2.落实政府采购政策需满足的资格要求：本项目专门面向中小微企业采购 3.本项目的特定资格要求：【包1】 ********投标人应具有独立承担民事责任的能力，提供营业执照或事业单位法人证书等证明文件（原件扫描件加盖电子签章）。********投标人应具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度。投标人须提供财务状况报告或证明材料，内容可以为以下三者之一：(1)2025年1月前成立的投标人可提供以下①或②任意一种： ①提供2023年或20经第三方审计的财务报告及报表（报表至少应包括资产负债表、利润表（损益表）、现金流量表、所有者权益变动表及其附注），财务报告及报表须附可通过统一监管平台进行查验的验证二维码（扫描件加盖电子签章）；②提供自投标文件提交截止前三个月内基本开户银行出具的资信证明（原件扫描件加盖电子签章）。(2)2025年1月至今成立的投标人提供自成立至今的财务报表或提供具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度承诺书（或书面声明）（原件扫描件加盖电子签章）。(3)提供财政部门认可的政府采购专业担保机构出具的投标担保函（原件扫描件加盖电子签章）。********投标人应具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录，提供开标前1年期内任意3个月的依法缴纳税收和社会保障资金的证明材料（原件扫描件加盖电子签章），成立不足1年的投标人可提供自成立以来任意1个月的税收和社会保障资金缴纳凭证或相关情况说明（原件扫描件加盖电子签章）；投标人成立不足3个月的，提供情况说明即可（原件加盖电子签章）；依法免税或不需要缴纳社会保障资金的投标人，应提供相应文件（原件扫描件加盖电子签章）证明其依法免税或不需要缴纳社会保障资金。********投标人应具有履行合同所必需的设备和专业技术能力，提供承诺函或证明材料（扫描件加盖电子签章）。********投标人近三年内，在经营活动中没有重大违法记录（指投标人因违法经营受到刑事处罚或者责令停产停业、吊销许可证或者执照、较大数额罚款等行政处罚），提供承诺函（原件加盖电子签章）。********投标人未对本项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务，提供承诺函（原件加盖电子签章）。********投标人法定代表人或单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同投标人，不得同时参加本项目的投标，提供承诺函（原件加盖电子签章）。********符合法律、行政法规规定的其他条件，提供承诺函（原件加盖电子签章）。********因系统字数限制，本条内容详见其他补充事宜第1点。

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