一、项目基本情况 项目编号：Jp******** 项目名称：教育部重大慢病发病机制及综合诊疗医药基础研究创新中心设备更新项目——第三代基因测序仪采购项目 包组编号：001预算金额（元）：******** 最高限价（元）：******** 采购需求：查看 001-1 第三代基因测序仪（数量：1套、进口）；★一、功能需求对生物样本进行核酸分析，无需PCR过程，直接对DNA/RNA进行序列分析，分析过程可同时检测核酸修饰。适应于现场人员、动植物、细菌、病毒等生物样本。应用范围：全基因组测序、靶向测序、RNA 测序、宏基因组测序、表型研究等。样本类型包括人类基因组、动植物基因组、微生物基因组以及各种临床标本的 DNA 和 RNA；二、主要技术参数1.第三代纳米孔测序仪主机******** 单分子测序： DNA/mRNA 直接测序，无需 PCR 扩增，免除 PCR 扩增带来的错误和 GC 偏差；直接对样品进行检测，无需荧光标记； ★********长读长：可读取提取核酸的全长，最长可读取4Mbp；******** 测序起始量：从pg级到ug级都可以进行建库；******** 建库：配合快速建库试剂盒使用，可以在10分钟之内完成文库的制备；******** 运行：1 min - 72 h；★******** 直接 RNA 测序：提取RNA无需转换成cDNA即可进行测序；******** 碱基修饰：甲基化检测：碱基修饰基于电信号的差异检测碱基，在 DNA/mRNA 测序同时可直接检测碱基修饰；******** 速度：DNA测序速度最高可达450碱基每秒，RNA测序最高可达70碱基每秒；******** 实时数据输出：核酸上机后大于等于 2min即可产生实时数据，便于监控核酸及建库质量，并可以实时序列比对；******** 准确度：读取30次目标DNA序列中的每一个碱基，测序准确度可达********%；******** 使用成本：配合清洗试剂盒，纳米孔芯片可以多次使用；★******** 纳米孔芯片数据产量：单张芯片实际产出为30Gb数据量；********清洗试剂盒可用于测序芯片的清洗和再利用。2.分析服务器******** 分析服务器硬件参数：CPU数量≥1；GPU数量≥1；CPU主频≥********，核心数≥6核，线程数≥12；GPU显卡内存≥5Gb；CUDA核心≥1024；显示器：≥ 22英寸；分辨率：≥1920 X 1080；内存：≥32G，固态硬盘≥1920Gb；企业级机械硬盘容量≥4Tb；★******** 乌班图操作系统：基于Linux内核的开源操作系统，支持x86、x86_64、ARM等多种架构。3.核酸荧光定量计******** 可定量 dsDNA、ssDNA、RNA 或蛋白质的浓度。4．磁力架******** 用于对包括细胞在内的小分子进行温和的管式分离和纯化。5.系统软件********序列比对系统：测序得到的读长与参考基因组进行比对，从而确定读长在基因组中的位置和方向。★******** 测序数据较正系统：对原始数据进行处理和优化，提高数据的准确性的功能******** 变异分析系统：识别样本基因组与参考基因组之间的差异，包括单核苷酸变异（SNVs）、插入/缺失（Indels）、结构变异（SVs）和拷贝数变异（CNVs）********修饰分析系统：检测和分析DNA或RNA分子上的化学修饰（如甲基化、羟甲基化等），可检测5mC、5hmC、m6A等********宏基因组分析系统：复杂微生物群落中的所有基因组进行测序和分析，以揭示微生物的多样性、功能和相互作用。宏基因组分析无需分离培养单个微生物，直接对环境样本（如土壤、水体、肠道等）中的DNA进行测序。★

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